Que el PC no te arranque con las 2 es lo más normal del mundo. Perdona que te diga, pero un poco basto sí que eres!!!!!!!! ;-).
Ahora en serio, ¿cuando instalas la PCI se oye algun pitido del PC o se queda en silencio?.
Si hubiera algun error, la BIOS te lo indica con una serie de pitidos del altavoz del PC. O si no hay ninguno, lo normal es que solo se oiga uno (como cada vez que arrancas el ordenador normalmente).
Lo primero que arranca del ordenador, antes que la propia BIOS, es la tarjeta gráfica, así que si no oyes ningun pitido significa que ésta aun no se ha cargado y la tarjeta gráfica tiene algun problema.
Comprueba si la has encajado bién, cambia el slot o límpialo con un cepillito (no sea que tenga polvo, a veces pasa).
Ya nos comentas por aquí lo que sea, suerte!.
P.D.: Ahora al contestar me encuentro con la otra respuesta que te ha dado el compañero. Si esa opción no está en tu BIOS, lo que puede suceder es que el slot PCI no tenga asignada ninguna IRQ.
Si eso sucediera, lo tendrás que mirar en las opciones PCI de la BIOS ("PCI configuration" o algo así).