Yo uso este: pazera-software.com/products/mkv-to-avi-converter para convertir a XviD y MPG. Funciona bastante bien, no deja marcas de agua, puedes elegir también la resolución, el códec de audio… El 2-pass encoding no funciona, así que desactívalo siempre (o te va a dar una calidad pésima). Y el bitrate del vídeo te recomiendo que no lo dejes en Auto, haz un par de pruebas con distintos números y quédate con lo que te convenza.
El único fallo de verdad que le veo es que, a no ser que sepas de ffmpeg (que yo no sé), no se pueden añadir subtítulos incrustados/quemados (los que van incorporados en la propia imagen). Cuando lo necesito, uso este otro videotovideo.org (también gratis y sin marcas de agua), pero no acepta vídeos de entrada con códec HEVC/H.265, así que puede ser un poco coñazo.