te comento, el ventilador que saque aire tiene que estar situado lo mas ariba posible en la caja, lo mejor para estos casos es uno de chimenea pero te afea mucho la caja, con que el ventilador que pongas esté mas alto que el procesador es suficiente.
Tan importante como los ventiladores que pongas es la posicion donde los pongas y si meten o sacan aire; yo tengo uno de 8 cm sacando aire(aparte del de la fuente de alimentacion) y uno de 10 metiendo, el que mete aire esta situado en el frontal de la caja lo mas abajo posible, y el de 8 que saca esta situado justo debajo de la fuente de alimentacion, fijate si es importante el orden en que esten colocados los ventiladores, que si cambio el orden, es decir, el que esta metiendo aire lo pongo en el mismo sitio pero a sacar y viceversa con el otro, no solo no refrigera el sistema si no que bloquea el efecto de la fuente de alimentacion y el sistema se calienta mas.
Por ultimo, piensa que la cantidad de aire que mueven los ventiladores de entrada tiene que ser mas o menos igual que la cantidad de aire que mueven los de salida, incluyendo la fuente de alimentacion, por que si no estas haciendolos trabajar y recalentandolos sin obtener ningun beneficio, y tambien es muy importante lo que tengan delante los ventiladores, si tienes una caja preparada para poner ventilador de las que llevan simplemente agujeros, es mejor cortar toda la zona donde va el ventilador para que no haga ruido y trabaje mas ligero, los del frontal de la caja como no se suelen ver se puede recortar si que afee el conjunto, y para los traseros lo mejor es poner una rejilla de las de acero, que impide que metas los dedos y deja circular el aire sin problemas.