Asegúrate de que limitas bien la velocidad de subida y bajada de todo lo que pasa por el router: por ejemplo, si tu subida es de 300kbits, intenta no subir a más de 15-20kb/s entre el emule+torrent, y deja también algo reservado para la bajada.
Si se te cuelga el router, intenta configurar el eMule probando a limitarle las conexiones a 300, por probar, y si no, a 200, a ver cómo responde, a ver si ya no tienes que reiniciarlo más.
Esto que te voy a comentar, funciona con otros operadores, pero desconozco si Yacom te asigna una IP fija para la Vozip, en cuyo caso lo mismo no te funciona: si te deja IP variable, siempre puedes probar a usar un dialer: con XP y el RasPPPoE, y no necesitas poner el router en modo Bridge ni nada: lo dejas tal cual, con su Nat y su VozIP, y usas el dialer con los datos de tu conexión en el PC con los P2P, y XP usará el internet desde el dialer, con otra IP de calle diferente a la que obtiene el router. El problema es que si te ponen IP fija, lo mismo el dialer no puede obtener otra IP, eso ya lo tendrás que probar. Con Jazztel por ejemplo, funciona: tengo un amigo que usa su router con su Nat, y luego, tiene 3 PCs con dialers, y obtiene una IP de calle distinta con cada dialer.