Hoy voy a pasar la web a Apache 2.
Creo que esta todo listo pero si alguien detecta un fallo que avise. Procuraré estar pendiente para solucionarlo cuanto antes.
La nueva configuracion es:
Apache 2 con worker MPN
PHP 5.2.0 con eAccelerator por FastCGI
Si la cosa sale mal habra que volver atrás.