Si bien quilloquepasa ha comentado una forma de arrancar DOS desde USB, hay un problema que afecta a todas las instalaciones de Windows 2000 y Windows XP.
Resulta que en la primera parte del proceso de instalación, cuando todavía están las pantallas azules de texto, se resetea el bus del USB, y si estaba leyendo de ahí, se queda completamente frito y no hay forma de seguir adelante.
Habría que hackear el proceso de instalación original, y aunque todo es factible con el suficiente tiempo y esfuerzo, la gente que empezó a mirarlo se vio en un callejón sin salida. Además, se comentaba que Vista sería instalable desde USB y querían esperar a la versión definitiva para intentar copiarse del método usado ahí.
Así estaban las cosas en Octubre, que fué cuando lo miré la última vez, y no sé cómo ha evolucionado.