Instalación de Windows XP limpia (dual boot) W2000 (formateo de C: FAT32->NTFS)

Da lo mismo, pero si formateas es más rápido, porque convertir con ficheros es un proceso más lento, pero no mucho más.

Basta con agregar la entrada al boot.ini y en default la que quieras arrancar, el resto de ficheros son los mismos para 2000 y XP

multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professional" /fastdetect

Yo recuerdo cuando apareció el XP, hice una instalación limpia, después quise instalar el W98SE porque los drivers de mi escaner Agfa (maldita la hora que lo compre) no funcionaban bien en XP, y pude hacerlo, porque lo instalé en otro disco duro, pero el arranque dual no consegui que funcionara por mucho que edite el boot.ini preguntando por varios foros, terminé aburrido, al final tenía que hacerlo cambiando el disco de inicio en la BIOS. Según lei en un artículo de Microsoft era porque el arranque dual de XP si funciona si ya tienes esa otra versión de Windows instalada pero no si instalas otra después. Me extraña que en tu caso no te funcionara, y mas aún que perdieras todos los datos, si no he entendido mal, entonces no podias inciar ni el 2000 ni el XP recien instalado. Cuando comienzas a instalar XP puedes acceder a la consola de recuperación, veras un mensaje por ahi, creo que era pulsando F6, ahi tienes disponibles algunos comandos que te pueden ayudar en caso de problemas, como Diskpart, Fixboot y Fixmbr.

Espero que te funcione simplemente modificando el boot.ini, pero por si acaso yo te recomendaria dos cosas. Una hacer una copia de la partición del W2000, si no tienes ningun programa busca el Norton Ghost, busca la versión del DOS, es un solo archivo .exe y solo funciona en modo DOS, hay que ponerlo en un disquete o CD con arraque DOS, y tener espacio en alguna partición para guardar la copia de la partición, el tamaño equivale solo a los datos no al tamaño completo de la partición, ademas se puede usar compresión, y una vez hecha si quieres la guardas en un CD por si algo sale mal restaurarla. Si no encuentras esa versión, instala la versión completa para Windows y busca entre las utilidades y archivos de este programa la versión del DOS. Lo segundo, una vez instalado XP, si al menos puedes iniciar con XP, debería, pero no te funciona el arranque dual, busca alguna utilidad para tal menester, deben haber bastantes para hacer arranques múltiples con con varios sistemas operativos.

Otra cosa, es mejor formatear que comvertir de FAT32 a NTFS, no ya por la rapidez, sino porque te va asignar el tamaño de cluster mas pequeño, 512 bytes, y si desperdiciaras menos espacio, pero perderas velocidad en el disco. Por defecto cuando formateas asigna un tamaño de cluster de 4 KB, que es el ideal para la partición del sistema con tantos archivos pequeños, bueno lo ideal sería mas grande, pero entonces no se pueden usar algunos atributos NT como la compresión y el cifrado, si no recuerdo mal, estoy algo oxidado.