Lo primero, el WPS no es ningún cortafuegos, es un "protocolo" por llamarlo de alguna manera, para realizar la conexión wifi con dispositivos que tengan esa funcionalidad incorporada sin usar los métodos tradicionales de buscar red, poner clave... Y además, por defecto esa opción está deshabilitada en el equipo, tienes que ir a la configuración del router y activarla para que ese botón haga algo.
El wifi, cualquier aparato wifi, tiene pérdida de velocidad con respecto a la conexión por cable, y depende de muchísimos factores el que la diferencia sea mayor o menor, son limitaciones de la propia tecnología. No sé a qué publicidad te refieres exactamente en la que se dice qué velocidad consigues por wifi, ni R ni ningún ISP te va a decir la velocidad que vas a tener y menos aun conectado por wifi, como mucho te asegurarán una velocidad mínima respecto a la contratada, y en el caso particular de R que es el que conozco, por wifi no garantizan ninguna, exigen que hagas el test por cable porque no les vale que no tengas toda la velocidad haciendo la prueba por wifi. Otra cosa es que te pongan en el manual la velocidad máxima que soporta y la velocidad de transmisión tanto por LAN como por WLAN, aquí tienes las especificaciones del router:
speedguide.net/routers/technicolor-thoms…ireless-1298
Y también podrás comprobar el tema de los puertos LAN, los 4 son puertos LAN tipo RJ-45 10/100 (son todos ethernet) no sé a que te refieres con que 2 son para entrada salida de datos y 2 son puertos ethernet, y en los 4 la transmisión es la misma