Básicamente, T1.413 es el protocolo antiguo y G.DMT es el nuevo; hacer, hacen lo mismo; y las diferencias como usuario de un nivel superior (TCP/IP) no te afectan mucho.
G.Lite es otro protocolo similar a G.DMT pero que no requiere splitter en la parte del cliente, pero a costa de limitar el ancho de banda máximo tanto de subida como de bajada. En España, este protocolo no se usa (que yo sepa).
En cuanto a las encapsulaciones, se trata de parámetros que se utilizan al crear el circuito ATM que se establece cuando se enciende tu router o modem con la central telefónica (DSLAM), estos parámetros son fijos y no puedes cambiarlos, pues cambiarlos supone que la negociación no será exitosa, y por lo tanto no se creará el circuito y en consecuencia, no tendrás Internet
Resumiendo, todos estos protocolos y parámetros no influyen mucho en tu conexión, en cuanto a los parámetros no puedes cambiarlos; y en cuanto a los protocolos podrás conectarte con T1.413 ó G.DMT indistintamente, pero no notarás ningún cambio.