En realidad hay bastantes, y muchos no necesitan que se miren las IP de ambos ordenadores y además son gratis.
Por ejemplo, con el MSN Messenger (que viene con el Windows) se puede hacer. Basta con que ambos tengais una cuenta de hotmail y se puede chatear, enviar archivos, etc..
Lo mismo con ICQ (www.icq.com).
Incluso con Mirc (www.mirc.com) además de para conectarse a canales IRC se puede mandar archivos a otra persona, basta con que ambos os metais en el mismo canal y hagais una transferencia DCC.
Hay muchas más pero con las 3 de arriba tienes más que de sobra para mandar lo que quieras, y de las 3 tienes información de sobra en sus páginas respectivas.
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Eso suponiendo que lo que quieras sea chatear/enviar ficheros etc... Si quieres conectarte con un juego entonces sí, basta que mireis que IP tiene cada cual, y si quieres conectarte a su ordenador como si estuvieras manejando su teclado/ratón entonces es más complejo (funcionalidad de Windows XP Pro de acceso remoto a escritorio, paquetes propietarios de administración etc.. que dudo que se ajusten a lo que quieres). Lo que desde luego no puedes hacer de ninguna forma es que aparezca su ordenador en "mis sitios de red" como si estuvierais conectados por red local.