Hola,
Debería indicar que distribución, y compilacióne sta usando... de todos modos, tampoco este es el foro apropiado a su pregunta, debiendo formularla en el foro de asterisk...
De todos modos, asterisk en sí, o sea, compilado en limpio, no guarda nada en el directorio público del apache, sino todo esta en /etc/asterisk, salvo que Ud. esta usando alguna caja de freepbx, o alguna distro precompilada de trixbox, o similar... estos en todo caso lo enlazarían al e¡directorio maestro del asterisk /ect/asterisk
Mire en /etc/asterisk/sip.conf sobre sip, y/o en /etcasterisk/iax.conf sobre el asterisk, y si alguno de estos ficheros tiene algun include, mire también en el include, allí tendrá la configuración de los truncales.
Un saludo,