Entiendo que quieres usar el Linksys como AP Wifi no?
Normal, aunque cuelgue un router neutro, el problema estará en el Thomson. Si quieres poner el WRT54GL como Ap, deshabilita la opcion wifi como te dicen, y conectas a un puerto LAN el WRT54GL puesto en modo AP. Pero con esto no vas a obtener ningun beneficio ya que la saturacion por conexiones se produce en el Thomson, que es el que sale a internet, el WRT54GL sólo hace de pasarela.
Revisa el limite de conexiones del thomson ( a veces lo dice la hoja tecnica del producto, o ponte en contacto con ellos ) y configuralas en tu programa p2p, actualiza tambien el firmware.
Por ultimo decirte que el p2p no rinde tan bien via wifi que por cable.